Das Präsidium des BDE leitet die Tätigkeiten des Verbandes nach mit dem Vorstand abgestimmten Richtlinien. Die Präsidentin vertritt den Verband in allen Angelegenheiten. Sie kann von bis zu fünf ehrenamtlich tätigen Vizepräsidenten vertreten werden.
Der Präsident des korporativen Mitgliedes Verband der Bayerischen Entsorgungsunternehmen e. V. (VBS) ist in das Präsidium des BDE kooptiert. Weitere Mitglieder können ebenfalls in das Gremium kooptiert werden.
Seit 2009 kann der Verband von einem Hauptgeschäftsführer oder hauptamtlichen Präsidenten geführt werden. Nach einer entsprechenden Satzungsänderung durch die Mitgliederversammlung wählte das Präsidium Anja Siegesmund zur Geschäftsführenden Präsidentin.
Persönlichkeiten, die über eine langjährige Verbandserfahrung verfügen, können darüber hinaus in den Ehrenrat des BDE berufen werden. Der Ehrenrat kann aus bis zu vier Mitgliedern bestehen, wacht über die Einhaltung der Satzung und entscheidet in Angelegenheiten, zu denen er angerufen wird.
Geschäftsführende Präsidentin
PreZero Stiftung & Co. KG, im Präsidium zuständig für Biomasse
Buhck Umweltservices GmbH & Co. KG, im Präsidium zuständig für Umweltrecht und Wettbewerb
Lobbe Holding GmbH & Co. KG
Nehlsen AG, im Präsidium zuständig für Digitalisierung und Logistik
Veolia Holding Deutschland GmbH, im Präsidium zuständig für Kreislaufwirtschaft
Jakob Becker GmbH & Co. KG
REMONDIS Sustainable Services GmbH, im Präsidium zuständig für Europa, Wasser, fAK Öffentlichkeitsarbeit und Kommunikation
ALBA Group plc & Co. KG
Böhme GmbH Wertstofferfassung, Präsident des Verbandes der Bayerischen Entsorgungsunternehmen e.V. (VBS)
EEW Energy from Waste GmbH
Guido Adomßent
Veolia Umweltservice & Consulting GmbH
Bernfried Ahle
Rheinische Recycling GmbH
Carsten Dülfer
PreZero Service Deutschland GmbH
Dr. Andreas Fehr
Fehr Umwelt Hessen GmbH & Co. KG
Dr. Fritz Flanderka
Reclay Systems GmbH
Bernd Fleschenberg
TSR Recycling GmbH & Co. KG
Stephan Garvs
PreZero Dual GmbH
Kathrin Gerber-Schaufler
Mittelbadische Entsorgungs- und Recycling-Betriebe GmbH
Dr. Christian Hower-Knobloch
MVV Umwelt GmbH
Daniel Imhäuser
Blasius Schuster KG
Jochen Kilb
Kilb Entsorgung GmbH
Dr. Henning Knorr
Karl Meyer AG
Dr.- Ing Torben Kraffczyk
Meinhardt Städtereinigung GmbH & Co. KG
Rainer Kröger
ALBA Group plc & Co. KG
Peter Kurz
Kurz Entsorgung GmbH
Robert Ristow
REMONDIS Wasser & Energie GmbH
Gloria Schönmackers
Schönmackers Umweltdienste GmbH & Co. KG
Lutz Siewek
Nehlsen GmbH & Co. KG
Nadine Speidel
GlobalFlow GmbH
Felix Steingaß
Jakob Becker Entsorgungs-GmbH
Reinhard Van Vlodrop
EGN Entsorgungsgesellschaft Niederrhein mbH
Michael Wieczorek
Lobbe Umweltservice GmbH & Co KG
Marcell Wiese
Lobbe Entsorgung GmbH
Klaus Wohnig
Atmedio GmbH
Otto Heinz
HEINZ Entsorgung GmbH & Co. KG
Dr. Johannes F. Kirchhoff
FAUN Umwelttechnik GmbH & Co. KG
Dr. Armin Vogel
SSI Schäfer Plastics GmbH
Jakob Becker GmbH & Co. KG
Lobbe Holding GmbH & Co. KG
Rethmann SE & Co. KG